Investigadores del IRYCIS estudian mediante secuenciación de genomas completos la epidemiología y los mecanismos de resistencia en aislados multirresistentes de Pseudomonas aeruginosa procedentes de UCI de Portugal y España
Los resultados de este trabajo ayudarán a una mejor prescripción de los antimicrobianos en los programas de optimización de su uso (PROA) y a las estrategias encaminadas a reducir las resistencias bacterianas.
La Dra. MARTA HERNÁNDEZ GARCÍA, integrante del Grupo Biología y Evolución de Microorganismos del IRYCIS, cuyo responsable es el Dr. Rafael Cantón, Jefe de Servicio Microbiología del Hospital Universitario Ramón y Cajal y autor sénior del trabajo, ha publicado recientemente en la prestigiosa revista J Antimicrob Chemother un trabajo, en el que participan además de otros colaboradores del Grupo, numerosos investigadores de distintos Laboratorios y Servicios de Microbiología de varios Hospitales de Portugal y de España, así como el Departamento médico de MSD España y Portugal y otros colaboradores de los estudios de vigilancia STEP y SUPERIOR.
El objetivo de este trabajo fue analizar la epidemiología, el resistoma y el viruloma de aislados clínicos multirresistentes de Pseudomonas aeruginosa, centrándose en los mecanismos de resistencia a ceftolozano-tazobactam (C/T), recogidos durante dos estudios de vigilancia epidemiológica de la resistencia realizados en Portugal (STEP, 2017-2018) y España (SUPERIOR, 2016-2017). El C/T es la combinación de una nueva cefalosporina y un inhibidor clásico de β-lactamasas indicada en el tratamiento de infecciones complicadas intraabdominales y del tracto urinario y neumonía adquirida en el hospital, siendo adecuada en las causadas por cepas de P. aeruginosa resistentes a otros β-lactámicos, incluidas algunas que muestran resistencia a los carbapenémicos
Los aislados estudiados procedían de infecciones intraabdominales, infecciones del tracto urinario e infecciones del tracto respiratorio inferior de pacientes ingresados en unidades de cuidados intensivos (UCI) de 11 hospitales portugueses y 8 hospitales españoles. La sensibilidad antibiótica se estudió mediante microdilución en caldo y los aislados se clasificaron como sensibles o resistentes a C/T de acuerdo con los puntos de corte clínicos de EUCAST-2020. En total se analizaron mediante secuenciación de genoma completo (Illumina Novaseq 6000, OGC) un subgrupo de 28 aislados de P. aeruginosa con un fenotipo de resistencia a C/T (CMIC/T > 2mg/L). Además, se incluyó un subgrupo de 28 aislados con valores de CMI sensibles a C/T (CMIC/T ≤ 2mg/L).
En la colección de aislados estudiada, se observó diseminación clonal intrahospitalaria de clones de alto riesgo con elevado perfil de multirresistencia, pero limitada a la región geográfica, siendo los clones CC235, CC244, CC348, CC253 los más frecuentes en Portugal, y CC175, CC309 los predominantes en España. La producción de carbapenemasas se detectó en un 45% de los aislados siendo GES-13, VIM-2, VIM-20 y KPC-3 las más prevalentes. En Portugal, el CC235 se asoció mayoritariamente con la producción de GES-13, mientras que en España predominaron las metalo-β-carbapenemasas del grupo VIM asociadas con el CC175.
La resistencia a C/T se asoció significativamente con la producción de GES-13 y las carbapenemasas de tipo VIM, mientras que los aislados productores de KPC-3 y VIM-36 mostraron un fenotipo salvaje a C/T. Es de destacar que 6 aislados de P. aeruginosa no productores de carbapenemasas mostraron también resistencia a C/T, y en tres de ellos se detectaron mutaciones conocidas en el gen ftsI-PBP3 (R504C y F533L) asociadas previamente con la resistencia a esta combinación de antibióticos.
Por otro lado, se identificó un viruloma extenso en todos los aislados de P. aeruginosa, particularmente en las cepas productoras de las carbapenemasas GES-13 y tipo VIM.
A pesar de la proximidad geográfica de ambos países, en los estudios de vigilancia STEP y SUPERIOR se observaron diferencias en la distribución de los mecanismos de resistencia antibiótica en los aislados clínicos multirresistentes de P. aeruginosa de pacientes ingresados en UCI. Los clones CC235-GES-13 y CC175-VIM fueron los aislados de P. aeruginosa más frecuentemente encontrados en las UCI de Portugal y España, respectivamente. La producción de carbapenemasas fue el principal mecanismo de resistencia a C/T. Sin embargo, en ausencia de carbapenemasas/β-lactamasas adquiridas horizontalmente, mutaciones en genes que codifican las PBP podrían también estar implicadas en la resistencia a C/T.
Marta Hernández-García, María García-Castillo, Sergio García-Fernández, José Melo-Cristino, Margarida F Pinto,..., Rafael Cantón, STEP and SUPERIOR study groups. Distinct epidemiology and resistance mechanisms affecting ceftolozane/tazobactam in Pseudomonas aeruginosa isolates recovered from ICU patients in Spain and Portugal depicted by WGS. J Antimicrob Chemother. 2020 Oct 25;dkaa430. doi: 10.1093/jac/dkaa430. PMID: 33099623.
