Biomarcadores y dianas terapéuticas basados en miRNAs

Responsable

Elisa Conde Moreno

Personal

Edurne Ramos Muñoz (técnico apoyo)

Apoyo del grupo de Biomarcadores y Dianas Terapéuticas del IRYCIS, liderado por la Dra. Laura García Bemerjo

  • Equipamiento
    • Dos equipos para qRT-PCR (Lightcycler 480)
    • Equipo para hibridación in situ (DAKO)
    • Equipo para cuantificación de ácidos nucleicos: Bioanalyzer, NanoDrop
    • Microtomo y baño para bloques de parafina
    • Espectofotómetro
    • Microscopio invertido de fluorescencia con cámara y ordenador aclopados
    • Unidad de Cultivos Celulares: campanas de flujo laminar P2, incubadores regulares de CO2, incubador de hypoxia, dispositivo RCTA para impedancia celular, baño termostatizado, microscopio de luz invertido, electroporador y tanque de nitrógeno.
       
  • Destacables
    • Han desarrollado un método de diagnóstico y pronóstico de fracaso renal agudo protegido por dos familias de patente (P200901825 y P2011320232), ambas con entrada en fases nacionales en ocho países.
    • Servicios de carácter claramente traslacional con experiencia en patología renal, preservación renal, oncología, sepsis, cardiología, etc.
  • Cartera de servicios

    miRNAs.- Preparación de muestras 

    Extracción RNA y cuantificación. Extracción de RNA total enriquecido en RNAs pequeños (tejido, tejido parafinado*, células, suero, plasma, otros biofluidos)
    *Puede llevar asociado costes de cortes de tejido parafinado

    • Análisis y cuantificación de RNA NanoDrop 
    • Análisis y cuantificación de RNA Biochip


    miRNAs: Determinación por qRT-PCR (LightCycler 480 SYBR green)

    Retrotranscripción de RNA; RNA Spike-in kit, UniRT; PCR en tiempo real (por miRNA y por muestra en triplicado); Análisis de datos con software apropiado.


    Array de miRNAs: preparación de muestras

    Extracción de RNA y cuantificación. Extracción de RNA total enriquecido en RNAs pequeños (tejido, tejido parafinado*, células, suero, plasma, otros biofluidos)
    *Puede llevar asociado costes de cortes de tejido parafinado

    • Análisis y cuantificación de RNA NanoDrop 
    • Análisis y cuantificación de RNA Biochip


    Array de miRNAs: retrotranscripción y array

    Retrotranscripción RNA (en 3 volúmenes); RNA Spike-in kit, UniRT; Syber; Array 1 panel (conf.A +  Conf. B, 762 miRNAs); Análisis de datos mediante software apropiado.


    Modulación de miRNAs in vitro

    Cultivo celular y transfección


    Localización de miRNAs por hibridación in situ

    *Puede llevar asociado costes de cortes de tejido parafinado


    Corte histológico de bloques de parafina