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PROTEÓMICA
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DESCRIPCIÓN
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Determinación de masas moleculares de fármacos, pequeña molécula, péptidos y proteínas
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Análisis por MS MALDI-TOF
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Identificación de proteínas
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Digestión + análisis MS + búsqueda en bases de datos. Análisis MS por huella peptídica o MS/MS (MALDI-TOF/TOF)
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Cuantificación péptidos
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Análisis por MS MALDI-TOF, relación con estándar interno, informe cuantitativo
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Inmunoproteómica
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Identificación de proteínas por MS combinada con western blot 1D/2D
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Electroforesis 1D
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1D en SDS-PAGE minigel/gel
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Electroforesis 2D
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2D en SDS-PAGE minigel/gel (no incluye tinción y escaneo)
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Tinciones
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Coomassie, plata por minigel/gel
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Escaneo gel
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Escaneo en Odyssey o ChemiDoc
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Etiquetado
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Marcaje sonda fluorescente
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Proteómica diferencial
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2D-DIGE (incluye gel 2D, etiquetado y escaneo)
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Proteómica diferencial
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Análisis bioinformático de datos
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ESTEROLES Y LIPOPROTEÍNAS
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DESCRIPCIÓN
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Análisis de esteroles
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Análisis de esteroles (colesterol, desmosterol, 7-deshidrocolesterol, etc.) en plasma, tejidos o células. El estudio incluye la extracción de los lípidos saponificables y la separación de los esteroles mediante HPLC y cuantificación a partir de la absorbancia específica
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Biosíntesis de colesterol
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Biosíntesis de colesterol (incorporación de acetato radiactivo a los distintos esteroles de la ruta biosintética). El estudio incluye la incubación de las células en presencia del trazador, la extracción de los lípidos, la separación de los esteroles mediante HPLC y la cuantificación de su radiactividad.
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Se entrega un listado de la radiactividad en los distintos esteroles (DPM/mg proteína).
Tiempo estimado de ejecución: 20 días
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Capacidad para estimular la exportación celular de colesterol (CEC)
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Determinación de la capacidad de muestras de plasma (total o sin LpB) para estimular la exportación de 3H-colesterol incorporado a células en cultivo.
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Se entrega un listado de grado de exportación de colesterol respecto a muestra control
Tiempo estimado de ejecución: según número de muestras (mínimo 20 días)
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LIPIDÓMICA
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DESCRIPCIÓN
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Extracción base de lípidos (10 muestras)
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Extracción con solventes orgánicos para aislar los lípidos de la muestra
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Extracción esfingolípidos (10 muestras)
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Extracción ampliada de lípidos para extraer la clase esfingolípidos
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Lipidómica estándar (CE, TG, PE, PC, DG, LPC, LPE, SM) (10 muestras)
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Análisis de especies moleculares pertenecientes a las clases: ésteres de colesterol (CE), trigliceridos (TG), diglicéridos (DG), fosfolipidos de colina (LPC, PC, SM), fosfolípiodos de etanolamina (LPE, PE).
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Lipidómica de esfingolípidos (SM, Cer, dhCer, HexCer, LacCer, Sulf) (10 muestras)
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Análisis de especies moleculares de esfingolípido pertenecientes a las clases: esfingomielina (SM), Ceramidas (Cer, dhCer), hexosilceramidas (HexCer), Lactosilceramidas (LacCer), Sulfátidos (Sulf).
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Lipidómica de fosfolipidos ácidos (PI,PS,CL,PG,BMP) (10 muestras)
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Análisis de especies moleculares de esfingolípido pertenecientes a las clases: esfingomielina (SM), Ceramidas (Cer, dhCer), hexosilceramidas (HexCer), Lactosilceramidas (LacCer), Sulfátidos (Sulf).
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Lipidómica de fosfolipidos ácidos (PI,PS,CL,PG,BMP) (10 muestras)
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Análisis de especies moleculares de lípido de carácter ácido: fosfatidilinositol (PI), fosfatidilserina (PS), fosfadidilgliceroles (PG, BMP), cardiolipinas (CL).
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Análisis bioinformático (10 muestras)
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El analisis bioinformático incluye: procesamiento y filtrado de señales del masas, integración de picos, corrección de cantidad de muestra, corrección por estándar interno, emisión de informe cuantitativo, gráficos y análisis de componentes principales (PCA).
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