Caracterización lipidómica y proteómica

Responsable

Diego Gómez-Coronado

Personal

Dr. Óscar Pastor Rojo (Lipidómica)

Dr. Alberto Alcazar (Proteómica)

Dra. Emma Mártinez (Proteómica)

Dr. Diego Gómez-Coronado (Esteroles y lipoproteínas)

Contacto

  • Equipamiento
    • Espectrómetro de masas MALDI-TOF/TOF UltrafleXtreme – Infraestructura financiada por el Instituto de Salud Carlos III (ISCIII) y los fondos Next Generation EU (IFEQ22/00111)

    • Equipos de electroforesis mono- y bi-dimensionales; equipos de IEF Multiphor II y Processor PLus.
    • Equipos de cromatografía biocompatible FPLC y de alta resolución HPLC, con inyector automático refrigerado, módulo de detección DAD, fluorescencia, UV visible y electroquímico, colector de fracciones y termostatizador.
    • Sistema de LC-MS de alta resolución cuantitativa con fuentes ESI y APCI.
    • Sistema GC-MS de cromatografía de gases y espectrometría de masas.
    • Ultracentrífugas.
    • Contador de centelleo Tri-Carb 4910 TR.
  • Cartera de servicios

    SERVICIO: DESCRIPCIÓN

    :

    PROTEÓMICA:

    • Determinación de masas moleculares de fármacos, pequeña molécula, péptidos y proteínas:  Análisis por MS MALDI-TOF
    • Identificación de proteínas: Digestión + análisis MS + búsqueda en bases de datos. Análisis MS por huella peptídica o  MS/MS (MALDI-TOF/TOF)
    • Cuantificación péptidos: Análisis por MS MALDI-TOF, relación con estándar interno, informe cuantitativo
    • Inmunoproteómica: Identificación de proteínas por MS combinada con western blot 1D/2D
    • Electroforesis 1D: 1D en SDS-PAGE minigel/gel
    • Electroforesis IEF: 1D Electroforesis en IEF strips
    • Electroforesis 2D: 2D en SDS-PAGE minigel/gel (no incluye tinción y escaneo)
    • Tinciones: Coomassie, plata por minigel/gel
    • Escaneo gel: Escaneo en Odyssey o ChemiDoc
    • Etiquetado: Marcaje sonda fluorescente
    • Proteómica diferencial: 2D-DIGE (incluye gel 2D, etiquetado y escaneo)
    • Proteómica diferencial: Análisis bioinformático de datos

    ESTEROLES Y LIPOPROTEÍNAS:

    • Análisis de esteroles: Análisis de esteroles (colesterol, desmosterol, 7-deshidrocolesterol, etc.) en plasma, tejidos o células. El estudio incluye la extracción de los lípidos saponificables y la separación de los esteroles mediante HPLC y cuantificación a partir de la absorbancia específica.
    • Biosíntesis de colesterol: Biosíntesis de colesterol (incorporación de acetato radiactivo a los distintos esteroles de la ruta biosintética). El estudio incluye la incubación de las células en presencia del trazador, la extracción de los lípidos, la separación de los esteroles mediante HPLC y la cuantificación de su radiactividad.
    • Capacidad para estimular la exportación celular de colesterol (CEC): Determinación de la capacidad de muestras de plasma (total o sin LpB) para estimular la exportación de  3H-colesterol incorporado a células en cultivo.
    • Lipoproteínas de baja densidad (LDL) humanas para investigación: Lipoproteínas de baja densidad (LDL) humanas para investigación.  Aisladas mediante ultracentrifugación y caracterizadas.
    • Lipoproteínas de baja densidad (LDL) acetiladas, para uso en investigación: Lipoproteínas de baja densidad (LDL) humanas para investigación. Aisladas mediante ultracentrifugación, modificadas con anhídrido acético y caracterizadas.
    • Lipoproteínas de baja densidad (LDL) marcadas con DiI, para uso en investigación. Lipoproteínas de baja densidad (LDL) marcadas con DiI, para uso en investigación.  LDL humanas aisladas mediante ultracentrifugación, marcadas con DiI y caracterizadas.

    LIPIDÓMICA:

    • Extracción base de lípidos (10 muestras): Extracción con solventes orgánicos para aislar los lípidos de la muestra
    • Extracción esfingolípidos  (10 muestras): Extracción ampliada de lípidos para extraer la clase esfingolípidos
    • Lipidómica estándar    (CE, TG, PE, PC, DG, LPC, LPE, SM) (10 muestras): Análisis de especies moleculares pertenecientes a las clases: ésteres de colesterol (CE), trigliceridos (TG), diglicéridos (DG), fosfolipidos de colina (LPC, PC, SM), fosfolípiodos de etanolamina (LPE, PE).
    • Lipidómica de esfingolípidos  (SM, Cer, dhCer, HexCer, LacCer, Sulf)  (10 muestras): Análisis de especies moleculares de esfingolípido pertenecientes a las clases: esfingomielina (SM), Ceramidas (Cer, dhCer), hexosilceramidas (HexCer), Lactosilceramidas (LacCer), Sulfátidos (Sulf).
    • Lipidómica de fosfolípidos ácidos  (PI,PS,CL,PG,BMP) (10 muestras): Análisis de especies moleculares de lípido de carácter ácido: fosfatidilinositol (PI), fosfatidilserina (PS), fosfadidilgliceroles (PG, BMP), cardiolipinas (CL).
    • Análisis bioinformático  (10 muestras): El analisis bioinformático incluye: procesamiento y filtrado de señales del masas, integración de picos, corrección de cantidad de muestra, corrección por estándar interno, emisión de informe cuantitativo, gráficos y análisis de componentes principales (PCA).

    **Consultar tarifas con la unidad