Unidad de genómica traslacional

Responsable

Gloria Muñoz Martín

Contacto

  • Equipamiento

    Laboratorio 1 - Zona de Preamplificación

    • Chemagic Magnetic Separation Module I (Chemagic MSM I) (Chemagen, PerkinElmer)
    • Espectrofotómetro Nanodrop 2000.
    • Bioanalizador Agilent 2200 TapeStation System.
    • Fluorímetro Qubit 2.0.


    Laboratorio 2 - Zona de Postamplificación

    • Personal Genome Machine de Ion Torrent (Chips 314, 316 y 318)
    • AB Library Builder.
    • Ion One Touch System.
       
  • Destacables
    • Miembros de la Global Alliance for Genetics & Health (GA4GH) desde 2014
    • Acuerdos de colaboración firmados con Sistemas Genómicos y Parque Científico de Madrid. 
    • Docentes en el Curso de Técnicas de Investigación Traslacional.
  • Cartera de servicios

    Extracción de ácidos nucleicos - DNA *

    Extracción automatizada

    Servicio Muestra Nota
    Extracción DNA de 5 ml de sangre_cabezal 12 12 Consultar tarifa para < 12 muestras**
    Extracción DNA de 350 ul de sangre_cabezal 96 96 Consultar tarifa para < 96 muestras**
    Extracción DNA de 2 ml de saliva_cabezal 12 12 Consultar tarifa para < 12 muestras**
    Extracción de DNA de sangre seca (papel 3,2 mm)_cabezal 96 96 Consultar tarifa para < 96 muestras**
    Extracción DNA de Tejido fresco 10 mg (tejido o células animales)_cabezal 12 12 Consultar tarifa para < 12 muestras**
    Extracción DNA de Tejido fresco 10 mg (tejido o células animales)_cabezal 96 96 Consultar tarifa para < 96 muestras**
    Extracción DNA de Tejido FFPE 10 µm section_cabezal 96 96 Consultar tarifa para < 96 muestras**
    Extracción DNA de plásmidos (1,5 ml de cultivo bacteriano)_cabezal 96 96 Consultar tarifa para < 96 muestras**
    Extracción RNA de 2,5 ml de sangre en tubos PAX-gene_cabezal 12 12 Consultar tarifa para < 12 muestras**

    Análisis de ácidos nucleicos

    Servicio Descripción Nota
    Análisis de DNA alta sensibilidad por electroforesis capilar Bioanalizador Tape Station 2200 El aparato analiza muestras múltiplo de 2
    Análisis de DNA amplio rango por electroforesis capilar Bioanalizador Tape Station 2200 El aparato analiza muestras múltiplo de 2
    Análisis de DNA genómico por electroforesis capilar Bioanalizador Tape Station 2200 El aparato analiza muestras múltiplo de 2
    Análisis de RNA alta sensibilidad por electroforesis capilar Bioanalizador Tape Station 2200 El aparato analiza muestras múltiplo de 2
    Análisis de RNA amplio rango por electroforesis capilar  Bioanalizador Tape Station 2200 El aparato analiza muestras múltiplo de 2

    Cunatificación de ácidos nucleicos

    Servicio Descripción
    Cuantificación de DNA por fluorimetría Qubit 2,0
    Cuantificación de RNA por fluorimetría Qubit 2,0
    Cuantificación de DNA por absorbancia UV (Nanodrop) y por fluorimetría (Qubit 2,0) Nanodrop y Qubit 2,0
    Cuantificación de RNA por absorbancia UV (Nanodrop) y por fluorimetría (Qubit 2,0) Nanodrop y Qubit 2,0


    Secuencia masiva

    Servicio Descripción Muestras Nota
    Generación de Librerías** Resecuenciación paneles de genes humanos (PCRs usuario, PCRs Multiplex, Captura), Genoma mitocondrial, Genomas microorganismos, Virus gripe A, Metagenoma 16S, Aptámeros, miRNAs, etc    
    Secuenciación Ion Torrent Kit 200 pb y Chip 314 (20 Mb) Generación del Template y secuenciación en Chip 314 v2 Uso de la química de 200 pb  
    Secuenciación Ion Torrent Kit 200 pb y Chip 316 (200 Mb) Generación del Template y secuenciación en Chip 316 v2 Uso de la química de 200 pb  
    Secuenciación Ion Torrent Kit 200 pb y Chip 318 (1 Gb) Generación del Template y secuenciación en Chip 318 v2 Uso de la química de 200 pb  
    Secuenciación Ion Torrent Kit 400 pb y Chip 314 (40 Mb) Generación del Template y secuenciación en Chip 314 v2 Uso de la química de 400 pb  
    Secuenciación Ion Torrent Kit 400 pb y Chip 316 (400 Mb) Generación del Template y secuenciación en Chip 316 v2 Uso de la química de 400 pb  
    Secuenciación Ion Torrent Kit 400 pb y Chip 318 (2 Gb) Generación del Template y secuenciación en Chip 318 v2 Uso de la química de 400 pb  
    Análisis bioinformático primario de datos de secuenciación     Consultar**
    Determinación molecular en fluidos biológicos     Consultar**


    * Preguntar por otras tarifas: DNA de líquido amniótico, plasma, frotis bucal, DNA/RNA viral, etc.
    ** Consultar las tarifas a la UCA-GT dado que el coste base puede variar para cada aplicación e incluso para cada experimento.