Laboratorio 1 - Zona de Pre-amplificación

• Chemagic Magnetic Separation Module I (Chemagic MSM I) (Chemagen, PerkinElmer)
• Espectrofotómetro Nanodrop 2000
• Bioanalizador Agilent 4150 TapeStation System
• Fluorímetro Qubit 2.0
• Varioskan LUX de Thermoscientific
• Congeladores -80ºC y -20 ºC
• Neveras 4ºC
• Sistemas de control de temperatura y gestión de alarmas.
• Lector de códigos bidimensionales TRACKER de los tubos de almacenamiento de muestras.
• Aplicación web para el registro y trazabilidad de las muestras, y para la gestión del espacio de los almacenes (Bio-e-bank, VITRO)

Laboratorio 2 - Zona de Post-amplificación

• 2 PCRs System 9700 de AppliedBiosystems
• VeritiPro 96-Well ThermalCycler de AppliedBiosystems
• Secuenciador MiSeq de Illumina

• Bioanalizador Agilent (Bioanalyzer Agilent 2100)
• QuantStudio™ Absolute Q™ Digital PCR System – Infraestructura financiada por el Instituto de Salud Carlos III (ISCIII) y los fondos Next Generation EU (IFEQ21/00175)

Bioinformática

• Servidor HPC para análisis NGS
• Servidor GPU para aplicaciones AI/ML
• Workstations de trabajo individual.
• 3 Cabinas de almacenamiento de alta capacidad.

• Acuerdos de colaboración firmados con varias empresas tecnológicas, pertenecientes a ASEBIO (Asociación Española de Bioempresas), y con universidades públicas y privadas nacionales e internacionales.
• Docentes en cursos de Técnicas de Investigación Traslacional, Ciencias Ómicas y Técnicas de Secuenciación Masiva (NGS).
• Garantía de calidad en el almacenamiento y procesamiento de las muestras, manteniendo la trazabilidad de las mismas, seguimiento de protocolos normalizados de trabajo (PNTs). Plan de limpieza, mantenimiento y verificación del laboratorio y los equipos.
• Formación continua del personal del laboratorio.
• Clúster de computación principal con 32 cpu-cores y 526Gb de memoria RAM.
• Cabina de almacenamiento de 40Tb y una conexión a internet de banda ancha con fibra óptica dedicada
• Todos los IPs del IRYCIS pueden solicitar una cuenta en el servidor de forma gratuita
• Todas las cuentas del personal interno del IRYCIS incluyen gratuitamente: 400 horas-core de computación por mes y 1Tb de almacenamiento.
• Los descuentos no son acumulables entre distintas cuentas del mismo IP.
• Cada IP del IRYCIS tiene derecho a una única cuenta con estos descuentos, cualquier cuenta extra que se solicite compartirá los descuentos de la cuenta principal.

**Se dispone de tarifas para todos los servicios. Consultar en la Unidad

Extracción de ácidos nucleicos - ADN *

Servicio	Unidad	Condiciones
Extracción ADN de 2 ml de sangre_manual	€/muestra o reacción	1 muestra
Extracción ADN de 250 mg de heces_manual		1 muestra
Extracción ADN de 5 ml de sangre_cabezal 12		1 muestra
Extracción ADN de 400 ul de sangre_cabezal 96		96 muestras
Extracción ADN de 2 ml de saliva_cabezal 12		Nº de muestras inferior a 12 unidades consultar tarifa (1)
Extracción de ADN  de sangre seca (papel 3,2 mm)_cabezal 96		Nº de muestras inferior a 96 unidades consultar tarifa (1)
Extracción ADN de Tejido fresco 10 mg (tejido o células animales)_cabezal 12		Nº de muestras inferior a 12 unidades consultar tarifa (1)
Extracción ADN de Tejido fresco 10 mg (tejido o células animales)_cabezal 96
Extracción ADN de Tejido FFPE 10 µm section_cabezal 96		Nº de muestras inferior a 96 unidades consultar tarifa (1)
Extracción ADN (1,5 ml de cultivo bacteriano)_cabezal 96		Nº de muestras inferior a 96 unidades consultar tarifa (1)
Extracción ADN de FFPE_		1 muestra
Extracción ADN de cultivo bacteriano_manual		1 muestra
Extracción ADN de orina_manual		1 muestra
Extracción ADN de saliva_manu		1 muestra
Extracción ADN varios tipos de muestras_manual		1 muestra
Extracción ADN varios tipos de muestras (depleción de ADN humano)_manual		1 muestra

Extracción de ARN (1)

Servicio	Unidad
Extracción ARN de 2,5 ml de sangre en tubos PAX-gene_cabezal 12	€/muestra o reacción
Extracción ARN de 2,5 ml de sangre en tubos PAX-gene_manual
Extracción ARN de leucocitos_manual
Extracción ARN de FFPE_manual
Extracción ARN de heces_manual
Extracción ARN varios tipos de muestras_manual
Extracción ARN de suero/plasma/células_manual

Extracción de ADN y ARN Especiales

Servicio	Unidad
*Preguntar por otras tarifas: ADN de líquido amniótico, plasma, frotis bucal, ADN/ARN viral, etc...	€/muestra o reacción

Análisis de ácidos nucleicos (1)

Servicio	Unidad	Condiciones
Análisis de ADN  alta sensibilidad por electroforesis capilar_Tape Station 2200	€/muestra o reacción	Nº de muestras de 48 o más unidades consultar tarifa (1)
Análisis de ADN  amplio rango por electroforesis capilar_Tape Station 2200
Análisis de ADN  genómico por electroforesis capilar_Tape Station 2200
Análisis de ARN alta sensibilidad por electroforesis capilar_Tape Station 2200
Análisis de ARN amplio rango por electroforesis capilar_Tape Station 2200

Cuantificación de ácidos nucleicos

Servicio	Unidad	Condiciones
Cuantificación de ADN o ARN  por absorbancia UV (Nanodrop) y por fluorimetría (Qubit 2,0)	€/muestra o reacción
Cuantificación de ADN o ARN  por absorbancia UV (Nanodrop)
Cuantificación de ADN o ARN por absorbancia UV (Nanodrop). Placa de 96 muestras.		Nº mínimo de muestras = 48
Cuantificación de ADN o ARN por absorbancia UV (Nanodrop). Autoservicio (6)
Cuantificación de ADN o ARN  por fluorimetría_Qubit 2,0
Cuantificación de ADN o ARN  por fluorimetría_Qubit 2,0. Placa de 96 muestras.		Nº mínimo de muestras = 48
Cuantificación de ADN o ARN por fluorimetría_Qubit 2,0. Autoservicio (6)
Análisis bioinformático primario de datos de secuenciación
Determinación molecular en fluidos biológicos

Cuantificación por chip Bioanalyzer

Servicio	Unidad
Cuantificación de ARN small (8)	1 muestra €/chip
Cuantificación de ARN (8)	1 muestra €/chip
Cuantificación de ADN (8)	1 muestra €/chip

PCR DIGITAL

Servicio	Unidad
Cuantificación absoluta de ácidos nucléicos (Cuant.+ chips+reactivos+sondas)(7)	1 muestra €/chip
Cuantificación absoluta de ácidos nucléicos (NO sondas)(7)	1 muestra €/chip
Cuantificación absoluta de ácidos nucléicos (Servicio técnico+Uso de  equipo)(7)	1 muestra €/chip
Cuantificación absoluta de ácidos nucléicos (Sólo uso de equipo)(7)	1 muestra €/chip
Detección y cuantificación de patógenos	1 muestra €/chip
Estudios de expresión génica
Diseño de experimento PCR DIGITAL: Absolute Q™

Secuenciación Sanger

Servicio	Unidad
Secuenciación Sanger Tubo	€/muestra o reacción
Secuenciación Sanger Placa (48/96)

Paneles Dirigidos (NGS)

Servicio
Generación de librerías (2)

Metagenómica (NGS)

Servicio
Metagenómica (secuenciación de ARNr 16S-18S e ITS).
Meta genómica (secuenciación Completa de ARNr 16S-18S e ITS)

Whole Genome Secuencing (NGS)

Servicio
Whole Genome Secuencing

Transcriptoma-RNASeq (NGS)

Servicio
Transcriptoma: mRNA
Transcriptoma: mRNA + lncRNA
Transcriptoma: smallRNA-miRNA
Metatranscriptoma: mRNA bacteriano

Identificación de biomarcadores

Servicio
Identificación de biomarcadores

Generación de librerías para NGS + carrera de MiSeq (5)

Servicio
Carrera Kit v2 PE: 2X150pb (300 ciclos): ~30 millones de lecturas
Carrera Kit v3 PE: 2X75pb (150 ciclos): ~50 millones de lecturas
Carrera Kit v3 PE: 2X300pb (600 ciclos): ~50 millones de lecturas
Carrera Kit v2 Micro PE: 2X150pb (300 ciclos): ~8 millones de lecturas
Carrera Kit v2 Micro PE: 2X150pb (300 ciclos): ~2 millones de lecturas
Carrera Kit v2 Micro PE: 2X150pb (500 ciclos): ~2 millones de lecturas
Carrera en MiSeq (incluye cartucho y reactivos de carrera) (3) (5)
Carrera Kit v2 PE: 2X150pb (300 ciclos): ~30 millones de lecturas
Carrera Kit v3 PE: 2X75pb (150 ciclos): ~50 millones de lecturas
Carrera Kit v3 PE: 2X300pb (600 ciclos): ~50 millones de lecturas
Carrera Kit v2 Micro PE: 2X150pb (300 ciclos): ~8 millones de lecturas
Carrera Kit v2 Nano PE: 2X150pb (300 ciclos): ~2 millones de lecturas
Carrera Kit v2 Nano PE: 2X250pb (500 ciclos): ~2 millones de lecturas

Carrera en MiSeq (sólo uso de equipo) (4)

Servicio
Carrera 150 ciclos
Carrera 300 ciclos
Carrera 600 ciclos

Generación de librerías para NGS + carrera NextSeq 550 (5)

Servicio
Carrera Kit v2 NextSeq High Output PE: 2X150pb (3000 ciclos): >400 millones de lecturas
Carrera Kit v2 NextSeq High Output PE: 2X75pb (150 ciclos): >400 millones de lecturas
Carrera Kit v2 NextSeq  Mid output PE: 2X150pb (3000 ciclos): >130 millones de lecturas
Carrera Kit v2 NextSeq  Mid output PE: 2X75pb (150 ciclos): >130 millones de lecturas

Carrera en NextSeq 550 (incluye cartucho y reactivos de carrera) (3) (5)

Servicio
Carrera Kit v2 NextSeq High Output PE: 2X150pb (3000 ciclos): >400 millones de lecturas
Carrera Kit v2 NextSeq High Output PE: 2X75pb (150 ciclos): >400 millones de lecturas
Carrera Kit v2 NextSeq  Mid output PE: 2X150pb (3000 ciclos): >130 millones de lecturas
Carrera Kit v2 NextSeq  Mid output PE: 2X75pb (150 ciclos): >130 millones de lecturas

Carrera en NextSeq 550 (sólo uso de equipo) (4)

Servicio
Carrera de 150 ciclos
Carrera de 300 ciclos

Carrera en NovaSeq 6000 (1)

Servicio
Carreras desde 800 millones de lecturas

Arrays CGH (hibridación comparativa de genoma)

Servicio
Array CGH 60k
Array CGH 180k-HD
Array CGH 180k-SNP

MLPA

Servicio	Unidad	Condiciones
MLPA	€/muestra o reacción	Para varias muestras consultar precio

Genotipado de microsatélites

Servicio
Análisis de microsatélites

Citogenética

Servicio	Unidad
Cariotipo	€/muestra o reacción
FISH

Varios (1)

Servicio
Controles de ADN genómico
Real-time PCR/Discriminación alélica
Otras determinaciones o estudios genéticos/genómicos

Prestación

Servicio	Unidad
Uso de termocicladores	€/hora
Purificación de producto de PCR mediante ExoSap	€/muestra o reacción

Asesoría

Servicio	Unidad
Diseño de experimentos /oligonucleótidos	€/hora
Asesoramiento técnico experimental	€/hora

Análisis bioinformáticos (1)

Servicio
Análisis secundarios y/o terciarios de los datos brutos

NOTAS

1. Consultar tarifas, ya que el coste base varía para cada aplicación y para cada experimento.
2. Re secuenciación de paneles de genes humanos (PCRs usuario, PCRs multiplex, captura), RNAseq, genoma mitocondrial, genomas de microorganismos, virus gripe A, metagenoma 16S, aptámeros, miRNAs, etc.
3. Reactivos de carrera + flowcell + uso de equipo.
4. Sólo uso del equipo; el usuario aporta el cartucho y los reactivos para la carrera.
5. SP: según presupuesto
6. El autoservicio incluye uso del equipo siempre supervisado por personal de la Unidad
7. Mínimo 4 muestras para correr un chip.
8. Mínimo 11 muestras para correr un chip.